照常進行修業之旅的小智（松本梨香 配音）、小剛（上田祐司 配音）、小霞（飯塚雅弓 配音）一行輾轉來到水之都奧多馬雷參加緊張刺激的水上競賽。奧多馬雷流傳著一個精彩的傳說，在很久很久以前，島上的老夫婦撿到一對孤兒兄妹，當邪魔出現時，兩兄妹化作威力強大的神奇寶貝拉帝歐斯和拉帝亞斯，他們擊敗邪魔，并賜予奧多馬雷人民名為“心靈水滴”的寶石作為守護。時至今日，神圣的心靈之滴卻引起一對盜賊姐妹（釋由美子 配音）...

百贊星人的妻子女百贊星人為了給丈夫報仇，派黑色奧特曼夏德奧特曼來到了地球。哉阿斯奧特曼在南極被夏德打敗了。受著戰敗的影響，朝日勝人（關口正晴 飾）失去信心，從MYDO辭職了。...

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